La historia de Cañizo de Campos comienza tempranamente con la ocupación de estas tierras en la prehistoria ya que los objetos encontrados en el yacimiento de «El Raso» pertenecen a la época del Paleolítico. Pero las civilizaciones que más tiempo han dominado estas tierras fueron los romanos que supieron ver el gran potencial de las lagunas saladas y otros pueblos que les siguieron como los mozárabes una presencia destacada en esta zona. De la herencia romana queda una figurita de bronce del siglo IV que fue encontrada en el denominado pago de Fuentemiro y que hoy se encuentra en el Museo de Zamora
La importancia de los mozárabes en este municipio viene fundamentada porque se cree que fueron ellos los que llevaron a cabo su repoblación en el siglo IX donde se asentaron a las orillas del río Valderaduey. Cerca de Cañizo se conserva una espadaña que se encontraba en la iglesia del lugar de Toldanos, que eran mozárabes que provenían de Toledo y que levantaron un poblado hoy ya desaparecido
En el siglo X el municipio pasa a pertenecer a la jurisdicción de Villalpando lo que ha hecho que en la actualidad se encuentre integrado en la Mancomunidad Intermunicipal del Raso de Villalpando y a que en 1234 dotó de fuero propio a Cañizo, aún hoy se conserva el documento foral
Por un tiempo y bajo la propiedad de los duques de Frías, hacia el siglo XIV, hace que por un tiempo Cañizo pase a depender de Burgos en el voto a las Cortes y a integrarse en la denominada provincia de las Tierras del Condestable y deja de depender del voto anterior y pasa a hacerlo de León en 1786
En 1833 pasa a formar parte de Medina de Rioseco en Valladolid y finalmente en 1858 pasa a integrarse en la provincia de Zamora dentro de la Región de León