La fauna es abundante y variada pudiendo constatar la presencia de numerosos invertebrados, insectos, arácnidos, peces, anfibios, reptiles, mamíferos y abundante variedad de aves
Ocasionalmente presencia escasa, pero estable, de zorros. También destaca la existencia ocasional de lobos y jabalíes en paso a sus territorios inmediatos
Dentro de la variedad de aves debemos diferenciar las que viven en la estepa de las que invernan en las lagunas
Entre las aves esteparias la reina es, sin duda, la avutarda que llega a contabilizar hasta 3000 ejemplares, una de las mayores concentraciones que se producen a nivel mundial. Además, destacan otras aves como el cernícalo primilla, el aguilucho cenizo, el sisón y la ortega entre otros
En el complejo lagunar se concentran casi el 50% de todas las aves acuáticas de Castilla y León. Entre las aves que llegan para reproducirse destacan la cigüeñuela, la avoceta, el aguilucho lagunero, la pagaza piconegra, el avefría, el azulón, el zampullín, la cigüeña blanca, el pato cuchara y el chorlitejo chico. Entre las especies que llegan para invernar o de paso destacan el ánsar común, la grulla común, el ánade friso, la cerceta común y la espátula
La fauna de las lagunas está estrechamente ligada a la estación del año. Dependiendo de la época, se pueden observar diferentes concentraciones de aves: